دفتر تبلیغات اسلامی حوزه علمیه قم در سال ۱۳۵۹ به پیروی از منویات رهبر کبیر انقلاب اسلامی (ره) و با هدف اشاعه ارزش‌های اسلامی، اقدام به تأسیس معاونت آموزش نمود. این معاونت با هدف ساماندهی، برنامه‌ریزی و توسعه مراکز آموزشی دانشگاهی، حوزوی و تخصصی تشکیل و وظیفه اصلی آن، نظارت کلان، دریافت گزارشات عملکرد و ایجاد هماهنگی در راستای اهداف مشترک آموزشی است.

هفت نهاد آموزشی معتبر زیر نظر این معاونت فعالیت می‌کنند . در این میان ، دانشگاه باقرالعلوم (ع)  مدرک دانشگاهی و سایر مراکز  مدارک حوزوی و تخصصی  اعطا می‌کنند. 

• • دانشگاه باقرالعلوم(ع)
  • مؤسسه آموزش عالی حوزوی امام رضا(ع)
  • مؤسسه آموزش عالی حوزوی معصومیه(س) (خواهران)
  • مؤسسه آموزش عالی حوزوی علامه مجلسی اصفهان
  • مدرسه علمیه تخصصی مجتهده امین اصفهان (خواهران)
  • مرکز تخصصی آخوند خراسانی مشهد
  • مرکز تخصصی طوبی مشهد (خواهران)